Table of Contents
Herramientas bioinformáticas para el análisis de datos ómicos
Lunes 17 Junio
Introducción a GNU/Linux
- 09:00 – 09:30 Bienvenida y descripción general del curso. Francisco García
- 09:30 – 10:45 Introducción al software libre. GNU/Linux. Javier Sepúlveda
- 10:45 – 11:00 Break
- 11:00 – 12:15 Introducción al software libre. GNU/Linux. Javier Sepúlveda
- 12:15 – 13:00 La utilidad del terminal de comandos. Jordi Durban
- 13:00 – 14:30 Comida
- 14:30 – 17:00 La utilidad del terminal de comandos. Ejercicios. Jordi Durban
Martes 18 Junio
Introducción a las tecnologías de alto rendimiento y análisis de datos ómicos
- 10:45 – 11:00 Break
- 11:00 – 13:00 Métodos estadísticos. Marta Hidalgo
- 13:00 – 14:30 Comida
- 14:30 – 17:00 Detección de biomarcadores en estudios con datos ómicos. Francisco García
- Herramientas: Babelomics, http://babelomics.bioinfo.cipf.es/ utilizando Firefox browser
-
- Metabolomics, Proteomics, Transcriptomics from arrays,…
- RNA-Seq, microRNA-Seq,…
Miércoles 19 Junio
Análisis de datos ómicos
- 09:00 – 10:45 Priorización de genes. Sandra Alandes
- Herramientas web: ENDEAVOUR: Gene prioritization, BEEGLE: Search genes from diseases
- Presentación: endeavour.pdf
- Ejercicios: endeavour.zip
- 10:45 – 11:00 Break
- 11:00 – 13:00 Caracterización funcional de resultados ómicos: análisis de enriquecimiento y análisis de interacción proteína-proteína. Francisco García
- Herramientas web: PANTHER: Classification System, STRING: functional protein association networks
- Ejercicios:
- 13:00 – 14:30 Comida
- 14:30 – 17:00 Análisis de rutas de señalización (http://hipathia.babelomics.org/). Marta Hidalgo
Jueves 20 Junio
Análisis filogenético
- 09:00 – 10:45 Introducción a la filogenia: alineamientos y modelos evolutivos (I). Mariana López
- 10:45 – 11:00 Break
- 11:00 – 13:00 Introducción a la filogenia: alineamientos y modelos evolutivos (II). Mariana López
- 13:00 – 14:30 Comida
- 14:30 – 17:00 Prácticas con Phylemon2. Jordi Durban
Viernes 21 Junio
Casos prácticos con datos reales y conclusiones
- 09:00 – 10:45. Jordi Durban
- 10:45 – 11:00 Break
- 11:00 – 12:30 Sergio Romera
- 12:30 – 13:00 Cierre del curso. Francisco García
