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==== A. Tesis doctorales ====
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  *[[http://roderic.uv.es/handle/10550/55208|Métodos de análisis de enriquecimiento funcional en estudios genómicos]]. Tesis de Paco García. 
  *[[https://riunet.upv.es/handle/10251/10987|Técnicas de conectividad cerebral y transferencia de información aplicado al estudio de la esquizofrenia]]. Tesis de Mariam de la Iglesia.
  *{{ :tfm:start:tesis_doctoral_1_.pdf |Study of molecular bases behind sex differences in non-alcoholic
fatty liver disease and multiple sclerosis through transcriptomic meta-analysis}}. Tesis de José F. Català-Senent. Mayo 2025.
  *En las estanterías del labo hay un montón de memorias de tfms y tesis que pueden ser útiles.

==== B. Memorias de trabajos de fin de máster, grado y diploma ====
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  -{{ :tfm:tfm_alicia_guillo_final_29jun2017.pdf |Meta-análisis funcional de estudios de cáncer colorrectal}}. Alicia Guilló Recuerda. Máster en Bioinformática UV,  Julio 2017. **Puntuación: 9**
  -{{ :tfm:tfm_sandra_alandes.pdf |Abordajes bioinformáticos para la integración funcional de datos transcriptómicos en Biomedicina}}. Sandra Alandes.  Máster en Biotecnología Biomédica UPV, 2016-17. **Puntuación: 9**
  -{{ :tfm:tfm_final_ana_040716.pdf |Análisis de exomas para el diagnóstico de neuropatías periféricas hereditarias}}. Ana Sánchez Monteagudo. Máster en Bioinformática UV,  Julio 2016. **Puntuación: 10**
  -{{ :tfm:tfm_rev3.0.pdf |Metaanálisis funcional de estudios de metilación de cáncer de mama}}. Antonio Manuel Trassierra Fresco. Máster en Bioinformática UV,  Sep 2017. {{ :tfm:tfm_antonio.pptx |Presentación.}}  **Puntuación: 9.8**
  -{{tfm:tfm_-_v5.pdf |Integración de datos transcriptómicos y metabolómicos en estudios oncológicos}}. Ayelén I. Rojas Benedicto. Máster en Bioinformática UV,  Sep 2017. {{ :tfm:presentacion_rojas_v01.pptx |Presentación.}} **Puntuación: 9.5**
  -{{ :tfm:trabajofinalgrado-paulanavarrete.pdf |Clasificación del conjunto de genes de Drosophila
melanogaster atendiendo al nivel de expresión en los distintos tejidos, para la comprensión de los mecanismos moleculares.}} Paula Navarrete López. Trabajo final de grado en Biotecnología UPV, Jun 2018. **Puntuación:8**
  - {{ :tfm:tfm_jfcatala.pdf |Detección y caracterización de las diferencias de género en la enfermedad del hígado graso no alcohólico desde una aproximación ómica}}. José F. Català Senent. Máster en Bioinformática UV,  Feb 2019. **Puntuación: 9.3**
  - {{ :tfm:tfm_alc.pdf |Aplicación del análisis radiómico en el estudio de 
 características biomédics de interés en gliomas de grado bajo}}. Adolfo López Cerdán. Máster en Bioinformática UV,  May 2019. Tutores: Francisco García-García, María de la Iglesia.**Puntuación: 9**.
  - {{ :tfm:tfm_ipd.pdf |Metaanálisis funcional de las diferencias de sexo en estudios ómicos de adenocarcinoma de pulmón}}. Irene Pérez Díez. Máster en Bioinformática UV,  May 2019. **Puntuación: 9.5**. Tutores: Francisco García-García, Marta Hidalgo.
  - {{ :tfm:tfm_raul_perez_moraga.pdf |Esquizofrenia y las alucinaciones auditivas: aproximación desde la neuroimagen.}} Raúl Pérez Moraga. Máster en Bioinformática UV,  May 2019. Tutores: Francisco García-García, María de la Iglesia. **Puntuación: 8.5**.
  - {{ :tfm:tfm_franc_casanova.pdf |Metaanálisis de las diferencias de sexo en los efectos del alcoholismo a nivel transcriptómico. }} Franc Casanova Ferrer.  Máster en Bioinformática UV,  Jul 2019. **Puntuación: 9.5**. Tutores: Francisco García-García, Marta Hidalgo.
  - {{ :tfm:arturo_gonzalez.pdf |Métodos de machine learning en estudios biomédicos. }} Arturo González Vilanova.  Grado de Biotecnología,  Sep 2019. {{ :tfm:defensa.zip |Presentación}}. **Puntuación: 9**
  - {{:tfm:tfm_javier_garcia_-_master_bioestadistica_-_metodos_de_clasificacion_supervisada_en_estudios_de_imagen_biomedica.pdf |Métodos de clasificación supervisada en estudios de imagen biomédica. }} Javier  García Dasí. Máster en Bioestadística UV,  Sep 2019. **Puntuación: 9** 
  - {{ :tfm:tfm_ruben_grillo.pdf |Metaanálisis funcional de la lesión medular a partir de estudios transcriptómicos en Rattus Novergicus.}}  Rubén Grillo Risco. Máster en Bioinformática UV, Sep 2019. **Puntuación: 9.5**.
  - {{ :tfm:tfm_pablo_malmierca_merlo_metafun_.pdf |MetaFun: herramienta web para la integración y caracterización funcional de estudios ómicos con técnicas de metaanálisis}}. Pablo M. Malmierca Merlo.  Máster en Bioinformática UV, Sep 2019. **Puntuación: 9.5**. Tutores: Francisco García-García, Marta Hidalgo.
  - {{ :tfm:miriam_ferreiro_sexdiff_alzheimer.pdf |Diferencias de sexo en enfermedad de Alzheimer mediante un metaanálisis de estudios transcriptómicos}}. Miriam Ferreiro. Máster en Biotecnología Biomédica UPV, Junio 2020. **Puntuación: 9**.
  - {{ :tfm:tfg_violetalillo.pdf |Caracterización de las diferencias de sexo en la enfermedad de Parkinson mediante el metaanálisis de estudios transcriptómicos}}. Violeta Lillo. Trabajo de fin de grado de Biotecnología UPV, Junio 2020. **Puntuación: 10**
  - {{ :tfm:tfg_alejandra_junio.pdf |Evaluación del papel pronóstico de las proteínas PIWI en cáncer mediante una estrategia in silico.}} Alejandra Morcillo. Trabajo de fin de grado de Biotecnología UPV, Junio 2020. {{ :tfm:presentacion_alejandra.pdf |Presentation.}} **Puntuación: 8.5**
  - {{ :tfm:single_cell_rna-sequencing_analysis_in_alzheimer_s_disease_-_v8-abg_.pdf |Single cell RNA-sequencing analysis in Alzheimer's disease}}. José Álvaro Ballesteros González.  Universitat Oberta de Catalunya, Julio 2020. **Puntuación: 9.7**
  - {{ :tfm:tfm_mulet.pdf |Evaluación comparativa de estrategias de análisis de datos en los estudios de microbioma}}. María Mulet. Máster en Bioinformática UV, Sep 2020. Tutores: Francisco García-García, María de la Iglesia.**Puntuación: 8.5**
  - {{ :tfm:tfm_18ago_.pdf |Métodos de metaanálisis de estudios ómicos en Biomedicina}}. Jesús Gutiérrez Botella. Máster en Bioestadística, Sep 2020. {{ :tfm:tfmexpo.pdf |presentación pdf}}, {{ :tfm:tfmexpo.pptx |}}. **Puntuación: 9.5**
  - {{ :tfm:tfm_maria_guaita.pdf |Evaluación de genes housekeeping en tejido adiposo, por sexo y especie, mediante el análisis masivo de datos}}.  María Guaita. Máster en Bioinformática UV, Sep 2020. **Puntuación: 9.4**. Tutores: Francisco García-García, Marta Hidalgo, Amparo Galán.
  - {{ :tfm:tfm_jose_antonio.pdf |Caracterización de las diferencias de sexo en enfermedades cardiovasculares desde una perspectiva ómica}}. José Antonio Sánchez. Máster en Bioinformática UV, Sep 2020. **Puntuación: 9.3**. Tutores: Francisco García-García, Marta Hidalgo.
  - {{ :tfm:tfg_definitivo_-_irene_canovas_cervera.pdf |Perfil consenso transcripcional de las diferencias de sexo en los accidentes cerebrovasculares}}.  Irene Cánovas Cervera. Trabajo de fin de grado de Biotecnología UPV, 1-7-2021. Tutores: Susana Barceló Cerdá (UPV), Francisco García García, Pablo Malmierca Merlo (CIPF). **Puntuación: 10**
  - {{ :tfm:tfg_yassir_el_hamdani_el_amri.pdf |Caracterización de las diferencias de sexo en las enfermedades cerebrovasculares mediante el metaanálisis de estudios transcriptómicos}}. Yassir El Hamdani El Amri. Trabajo de fin de grado de Biotecnología UPV, Julio 2021. Tutores: Javier Forment Millet (UPV), Francisco García García, Sergio Romera Giner (CIPF). **Puntuación: 8**
  - {{ :tfm:tfg_010721.pdf |Caracterización de las diferencias de sexo en artritis reumatoide mediante el metaanálisis de estudios transcriptómicos}}. Edurne Urrutia Lafuente. Trabajo de fin de grado de Biotecnología UPV, Julio 2021. Tutores: José Gadea Vacas (UPV), Francisco García García, Irene Pérez Díez (CIPF). {{ :tfm:presentacion_edurneurrutia.pdf |Presentación. }}**Puntuación: 9.5**
  - {{ :tfm:tfm_final_carlaperpinaclerigues.pdf |Estudio comparativo del perfil lipidómico exosomal en adolescentes expuestos a intoxicación alcohólica con perspectiva de sexo}}. Carla Perpiñá Clérigues. Trabajo de fin de máster en Bioinformática UV, Julio 2021. Tutores: María Pascual Mora (UV), Francisco García García(CIPF).  **Puntuación: 8.3**
  - {{ :tfm:tfm_lucia_fantin_1_.pdf |Caracterización de las diferencias de sexo en cáncer de páncreas ductal mediante el análisis masivo de datos transcriptómicos}}. Lucía Fantin. Trabajo de fin de máster en Bioinformática UV, Julio 2021. Tutores: Vicente Arnau Llombart (UV), Francisco García García (CIPF), Rubén Grillo Risco (CIPF), José Francisco Català Senent (CIPF). **Puntuación: 8.9**
  - {{ :tfm:tfm_irene_soler.pdf |Caracterización de las diferencias de sexo en esclerosis múltiple mediante estrategias basadas en el análisis masivo de datos}}. Irene Soler. Trabajo de fin de máster en Bioinformática UV, Julio 2021. Tutores: Vicente Arnau Llombart (UV), Francisco García García (CIPF), Zoraida Andreu (FIVO). **Puntuación: 9.5**. {{ :tfm:defensa_tfm_pt.pdf |Documento de presentación pdf. }}{{ :tfm:defensa_tfm_irene_soler.mp4 |Video-presentación}}
  - {{ :tfm:tfm_almudena_neva.pdf |Caracterización de las diferencias de sexo en la enfermedad de Alzheimer mediante estrategias basadas en el análisis masivo de datos de célula única}}. Almudena Neva. Trabajo de fin de máster en Bioinformática UV, Septiembre 2021. Tutores: María Pascual (UV), Francisco García García (CIPF), María de la Iglesia (CIPF-FISABIO). **Puntuación: 10**.
  - {{ :tfm:memoria-tfm-edmond-geraud-aguilar.pdf |Integration of Omics, and Clinical Data of the hormonal and inflammatory response at the basal level in response to the different macronutrients of the diet}}.  Edmond Géraud Aguilar.  Trabajo de fin de máster en Bioinformática y Bioestadística (UOC), Enero 2022. Tutores: Susana Barceló (UPV) y Francisco García García (CIPF). **Puntuación: 9.5**.
  - {{ :tfm:tfd_jpacheco_vfinal.pdf |Análisis de RNA-Seq, ensamblaje de transcriptoma de novo, y anotación funcional de dos cultivares de tomate de árbol (Solanum betaceum Cav.)}}  Juan Pacheco.  Diploma de especialización en Bioinformática y Biología Computacional, Febrero 2022.  Tutores: Rubén Grillo Risco y Francisco García García (CIPF). **Puntuación: 8**.
  - {{ :tfm:tfd_helenagomezmartinez.pdf |Nuevas Estrategias Computacionales para la Identificación de miARN como Factores del Diagnóstico en Melanoma}}. Helena Gómez Martínez. Diploma de especialización en Bioinformática y Biología Computacional, Febrero 2022.  Tutores: Adolfo López Cerdá y Francisco García García (CIPF). **Puntuación: 8**.
  - {{ :tfm:start:tfm_eva_maicas.pdf |Imputación de la variable sexo en estudios ómicos}}. Eva Maicas Alcaine. Máster en Bioestadística, Universitat Valencia, 7 Julio 2022. Tutores: Francisco García García (CIPF), Marta R. Hidalgo (CIPF), Anabel Forte Deltell (UV). {{ :tfm:start:presentacion_tfm.pdf |Presentación.}} **Puntuación: 9.6**.
  - {{ :tfm:start:tfg_estermunoz_def.pdf |Caracterización de las diferencias de sexo en esclerosis múltiple, mediante la revisión sistemática y metaanálisis de estudios transcriptómicos a nivel de microRNAs}}. Ester Muñoz. Grado de Biotecnología, Universidad Politécnica de Valencia, Junio 2022. Tutores: Francisco García García (CIPF), José F. Català-Senent (CIPF), Santiago Vilanova Navarro (UPV). {{ :tfm:start:presentacion_tfg_01.pdf |Presentación TFG}}. **Puntuación: 10**.
  - {{ :tfm:start:tfm_olga_rueda_lopez.pdf|Análisis de expresión diferencial de marcadores de obesidad y resistencia a insulina en tejido adiposo en función del sexo como variable}}. Olga Rueda López. Máster de “Aproximaciones moleculares en Ciencias de la Salud”. Universitat de València, Jul 2022. Tutores: Amparó Galán Albiñana, Francisco García-García. **Puntuación: 9.3**.
  - {{ :tfm:start:tfm_jaimelleraoyola.pdf |Estudio de las diferencias de sexo en la enfermedad d Alzhéimer: un metaanálisis de estudios de microRNA}}. Jaime Llera Oyola. Trabajo de fin de máster en Bioinformática UV, Jul 2022. Tutores: Francisco García García (CIPF), Vicente Arnau Llombart (UV). **Puntuación: 9.5**.
  - {{ :tfm:start:fernando_gordillo_gonzalez_tfm.pdf |Caracterización de las diferencias de sexo en la enfermedad de Parkinson mediante estrategias basadas en el análisis masivo de datos de célula única}}. Trabajo de fin de máster en Bioinformática UV, Jul 2022. Fernando Gordillo González. Tutores: Francisco García García (CIPF), Irene Soler Sáez (CIPF), Vicente Arnau Llombart (UV). **Puntuación: 10 **.
  - {{ :tfm:start:documentos_tfm_borja_gomez.zip |Enriquecimiento funcional en Gene Ontology: estudio y comparativa de aproximaciones contra la propagación génica}}. Borja Gómez Cabañes. Trabajo de fin de máster en Bioinformática UV, Jul 2022. Tutores: Francisco García García (CIPF), Marta R. Hidalgo García (CIPF), María Pascual Mora (UV). {{ :tfm:start:presentacion.pptx.pdf |Presentación}}. **Puntuación: 9.5**.
  - {{ :tfm:start:tfm_cristina_galiana.pdf |Reposicionamiento de fármacos en la enfermedad de Alzheimer: una aproximación in silico basada en el transcriptoma con perspectiva de sexo.}} Cristina Galiana Roselló. Trabajo de fin de máster en Bioinformática UV, Sep 2022. Tutores: Francisco García García (CIPF), Isabel del Pino (CIPF), Rubén Grillo Risco (CIPF), María Pascual Mora (UV). {{ :tfm:start:drugrepurposing_cg10.pdf |Presentación}}. **Puntuación: 10**.
  - {{ :tfm:start:tfg_cristina_magan_torres.pdf |Caracterización funcional del Melanoma Metastásico
Cerebral (MMC) mediante el análisis masivo de datos de expresión génica.}} Cristina Magán Torres.  Trabajo de fin de grado en Biotecnología UPV, Jun 2023. Tutores: Carla Perpiñá (CIPF), Gonzalo Antón (CIPF), Javier Forment (UPV).  **Puntuación: 9.5**.
  - {{ :tfm:start:tfm_aaron_garcia.pdf |Estudio integrativo del transcriptoma del corazón del pez cebra a lo largo del desarrollo. }} Aarón García Blázquez. Trabajo de fin de máster en Bioinformática UV, Jul 2023. Tutores: Francisco García García (CIPF), Irene Soler Sáez (CIPF), Beatriz Domingo Moreno, Amparo Galán Albiñana.  **Puntuación: 9.5**.
  - {{ :tfm:start:roxanamoldovan_tfm.pdf |Paisaje transcriptómico de las diferencias de sexo en obesidad y diabetes de tipo 2}}. Roxana Andreea Moldovan Moldovan. Trabajo de fin de máster en Bioinformática UV, Jul 2023. Tutores: Francisco García García (CIPF),Marta R Hidalgo, Amparo Galán Albiñana, Vicente Arnau Llombart. **Puntuación: 9.8**.
  - {{ :tfm:start:tfm_julen_santiago_agredano.pdf |Caracterización de las diferencias de sexo en el córtex cerebral de pacientes esquizofrénicos mediante un análisis de transcriptómica espacial}}. Julen Santiago Agredano. Trabajo de fin de máster en Bioinformática UV, Sep 2023. Tutores: Francisco García García (CIPF),Héctor Cárceller (CIPF-UV), Vicente Arnau Llombart. **Puntuación: 8**.
  - {{ :tfm:start:tfm_final.pdf |Reposicionamiento de fármacos basado en el transcriptoma para la enfermedad de Alzhéimer}}. Pau Camilleri Lledó. Trabajo de fin de máster en Bioinformática, Biología Computacional y Medicina Personalizada UPV, Dic 2023. Tutores: Francisco García García (CIPF),Cristina Galiana Roselló (CIPF-UV). **Puntuación: 8**.
  - {{ :tfm:start:master_universitario_en_biologia_computacional_y_bioinformatica_final_.pdf |Análisis Metagenómico Diferencial por Sexo y Genotipo, en la Microbiota Intestinal de Modelos Murinos Alcoholizados}}. Manuel Domínguez Pino. Trabajo de fin de máster en Bioinformática, Biología Computacional y Medicina Personalizada UPV, Mayo 2024. Tutores: Francisco García García (CIPF),María Pascual Mora (UV), Rubén Grillo Risco(CIPF). **Puntuación: 8**.
  - {{ :tfm:start:tfg_marti_romero_navarro.pdf  |Unveiling sex-based differences in autism spectrum disorder: a comprehensive meta-analysis of transcriptomic studies. }} Martí Romero Navarro.  Grado de Bioquímica y Biología Molecular,  Jul 2024. Tutores: Francisco García García (CIPF), Borja Gómez Cabañes (CIPF), Carla Perpiñá Clérigues (CIPF).  **Puntuación: **
  - {{:tfm:start:tfm_guillemdiegoesteve_definitivo.pdf |Comparación de metodologías de agrupamiento en transcriptómica espacial}}. Guillem Diego Esteve. Máster en Bioestadística UV,  Jul 2024.  Tutores: Francisco García García, Cristina Galiana Roselló y Alvaro Briz. **{{ :tfm:start:comparacion_de_metodologias_de_agrupamiento_en_transcriptomica_espacial.pdf |Presentación}}**
  - {{ :tfm:start:tfm_irenebonache.pdf |Comparativa de Métodos de Análisis en Transcriptómica Espacial para la Detección de Genes Espacialmente Variables}}. Irene Bonache Gómez. Máster en Bioestadística UV,  Jul 2024. Tutores: Francisco García García, Cristina Galiana Roselló y Anabel Forte Deltell. **{{ :tfm:start:presentaciontfm_final.pdf |Presentación}}**
  - {{ :tfm:start:anton_bernat_gonzalo_tfm.definitivo_v2.pdf |Desarrollo de una estrategia bioinformática integrativa para la identificación de genes y rutas biológicas específicas del sexo, en el transtorno del espectro autista}} Gonzalo Antón Bernat. Trabajo de fin de máster en Bioinformática UV, Jul 2024. Tutores: Francisco García García (CIPF),Irene Soler Sáez (CIPF), Amparo Galán (CIPF-UV). **Puntuación: 9.5**.


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  - {{ :tfm:tfg_rafaelsanchez-20190729t170742z-001.zip |Análisis de imágenes médicas para dar soporte al
diagnóstico de Alzheimer.}} Rafael Sánchez Romero. Grado  de Ingeniería Informática, Jul 2019. 
  - {{ :tfm:tfg_alvaro_lopez-20190729t170639z-001.zip |Clasificación de imágenes de resonancia magnética
cerebral mediante redes neuronales para el diagnóstico médico. }} Alvaro López Chilet. Grado  de Ingeniería Informática, Jul 2019.
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