En diversos escenarios ómicos disponemos de un grupo de genes de interés procedentes de un análisis transcriptómico, o bien de diferentes estudios genómicos donde hemos encontrado variantes causales de una determinada enfermedad o incluso una selección de genes obtenida tras una revisión bibliográfica.

Nos gustaría conocer qué funciones hay detrás de este grupo de genes. A través de los siguientes casos prácticos, coonoceremos con detalle qué estrategias y herramientas podemos utilizar en la caracterización funcional

Herramienta web de la Gene Ontology para la caracterización funcional de estudios ómicos: http://www.pantherdb.org/

1. Caracterización funcional de genes asociados a distrofias de retinas
2. Evaluación funcional del efecto de hormona T3 en estudio transcriptómico con datos de RNA-Seq

1. Evaluación funcional del efecto de hormona T3 en estudio transcriptómico con datos de RNA-Seq
2. Enriquecimiento funcional clusterProfiler

1. Obtención de anotación funcional para Human desde BioMart de Ensembl
2. Obtención de anotación funcional para Arabidopsis Thaliana desde BioMart de Ensembl
3. Evaluación funcional del efecto de hormona T3 en estudio transcriptómico
4. Ejercicios complementarios.