https://bioinfo.cipf.es/WODA.CSIC/ 2026-04-05T03:31:09+0200 https://bioinfo.cipf.es/WODA.CSIC/ https://bioinfo.cipf.es/WODA.CSIC/lib/tpl/prsnl10/images/favicon.ico text/html 2019-07-02T17:24:21+0200 fgarcia (fgarcia@undisclosed.example.com) https://bioinfo.cipf.es/WODA.CSIC/doku.php/ex_ppi?rev=1562081061&do=diff Redes de interacción proteína-proteína Introducción En múltiples investigaciones generamos diferentes de datos ómicos: * un grupo de genes o proteínas de interés procedentes de un estudio transcriptómico o proteómico * un grupo de genes detectados en diversos estudios genómicos, donde hemos encontrado variantes causales de una determinada enfermedad text/html 2019-06-26T11:18:07+0200 fgarcia (fgarcia@undisclosed.example.com) https://bioinfo.cipf.es/WODA.CSIC/doku.php/?image=feder_vertical_castellano.png&ns=&rev=1561540687&tab_details=history&mediado=diff&do=media <img src="https://bioinfo.cipf.es/WODA.CSIC/lib/exe/fetch.php/feder_vertical_castellano.png?w=490&h=500&t=1561540687&amp;tok=e24132" alt="feder_vertical_castellano.png" /> text/html 2019-06-26T11:17:57+0200 fgarcia (fgarcia@undisclosed.example.com) https://bioinfo.cipf.es/WODA.CSIC/doku.php/home?rev=1561540677&do=diff ---------- ---------- What is WODA? WODA (Web-based Omics Data Analysis) is a practical course to learn how to perform omics data analysis from webtools. What is this course for? Questions such as How can I find the causative mutation of the disease in this family? or What pathways are activated in my RNA-seq experiment? are becoming more frequent as text/html 2019-06-20T17:51:27+0200 fgarcia (fgarcia@undisclosed.example.com) https://bioinfo.cipf.es/WODA.CSIC/doku.php/ppi4?rev=1561045887&do=diff Caracterización funcional mediante redes de interacción proteína-proteína en estudio transcriptómico En un estudio transcriptómico con datos de RNA-Seq disponíamos de dos grupos experimentales: casos y controles. Tras realizar el análisis de expresión diferencial obtuvimos los siguientes resultados que te puedes descargar en este text/html 2019-06-20T10:32:04+0200 fgarcia (fgarcia@undisclosed.example.com) https://bioinfo.cipf.es/WODA.CSIC/doku.php/program?rev=1561019524&do=diff Herramientas bioinformáticas para el análisis de datos ómicos Lunes 17 Junio Introducción a GNU/Linux * 09:00 – 09:30 [Bienvenida y descripción general del curso]. Francisco García * 09:30 – 10:45 [Introducción al software libre. GNU/Linux. ]Javier Sepúlveda * 10:45 – 11:00 Break * 11:00 – 12:15 [Introducción al software libre. GNU/Linux. ] Javier Sepúlveda text/html 2019-06-20T10:31:50+0200 fgarcia (fgarcia@undisclosed.example.com) https://bioinfo.cipf.es/WODA.CSIC/doku.php/?image=primates.txt&ns=&rev=1561019510&tab_details=history&mediado=diff&do=media text/html 2019-06-20T08:39:40+0200 fgarcia (fgarcia@undisclosed.example.com) https://bioinfo.cipf.es/WODA.CSIC/doku.php/?image=filogeias_woda_2019.pdf&ns=&rev=1561012780&tab_details=history&mediado=diff&do=media text/html 2019-06-20T08:39:39+0200 fgarcia (fgarcia@undisclosed.example.com) https://bioinfo.cipf.es/WODA.CSIC/doku.php/?image=tp_reconstruccion_filogenias_woda2019.pdf&ns=&rev=1561012779&tab_details=history&mediado=diff&do=media text/html 2019-06-19T08:58:48+0200 fgarcia (fgarcia@undisclosed.example.com) https://bioinfo.cipf.es/WODA.CSIC/doku.php/?image=endeavour.pdf&ns=&rev=1560927528&tab_details=history&mediado=diff&do=media text/html 2019-06-18T17:06:19+0200 fgarcia (fgarcia@undisclosed.example.com) https://bioinfo.cipf.es/WODA.CSIC/doku.php/?image=hipathia_example.r&ns=&rev=1560870379&tab_details=history&mediado=diff&do=media text/html 2019-06-18T17:05:56+0200 fgarcia (fgarcia@undisclosed.example.com) https://bioinfo.cipf.es/WODA.CSIC/doku.php/?image=hipathia.pdf&ns=&rev=1560870356&tab_details=history&mediado=diff&do=media text/html 2019-06-18T14:44:59+0200 fgarcia (fgarcia@undisclosed.example.com) https://bioinfo.cipf.es/WODA.CSIC/doku.php/?image=ejercicios_resueltos.r&ns=&rev=1560861899&tab_details=history&mediado=diff&do=media text/html 2019-06-18T10:15:41+0200 fgarcia (fgarcia@undisclosed.example.com) https://bioinfo.cipf.es/WODA.CSIC/doku.php/?image=script.r&ns=&rev=1560845741&tab_details=history&mediado=diff&do=media text/html 2019-06-18T10:13:12+0200 fgarcia (fgarcia@undisclosed.example.com) https://bioinfo.cipf.es/WODA.CSIC/doku.php/?image=bioestadistica_intro.pdf&ns=&rev=1560845592&tab_details=history&mediado=diff&do=media text/html 2019-06-18T09:57:29+0200 fgarcia (fgarcia@undisclosed.example.com) https://bioinfo.cipf.es/WODA.CSIC/doku.php/software_list?rev=1560844649&do=diff Software list Clinical and biological databases: * Ensembl (<https://www.ensembl.org/index.html>) * Ciberer Spanish Variant Server (<http://csvs.babelomics.org/>) * Gene Expression Omnibus (<https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/>) Visualization: * BoxPlotR (<http://boxplot.tyerslab.com>) * Heatmapper (<http://heatmapper.ca>) Omics-based biomarkers detection and functional profiling: * text/html 2019-06-18T08:47:40+0200 fgarcia (fgarcia@undisclosed.example.com) https://bioinfo.cipf.es/WODA.CSIC/doku.php/?image=high_throughput_technologies_omics_data_and_analysis_tools.pdf&ns=&rev=1560840460&tab_details=history&mediado=diff&do=media