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29/09/2016 - 12:28
Navarra Biomed precisa contratar un especialista bioinformático con experiencia para la puesta en marcha de un servicio de apoyo a un proyecto de medicina genómica.
 

 


 

25/09/2016 - 13:55

A Cold Spring Harbour protocol based on Babelomics

Because there is no widely used software for analyzing RNA-seq data that has a graphical user interface, this protocol provides an example of analyzing microarray data using Babelomics. This analysis entails performing quantile normalization and then detecting differentially expressed genes associated with the transgenesis of a human oncogene c-Myc in mice.

 


 

15/07/2016 - 14:55

RNA-Seq blog on gsa4mirna

 
Functional interpretation of miRNA expression data is currently done in a three step procedure: select differentially expressed miRNAs, find their target genes, and carry out gene set overrepresentation analysis Nevertheless, major limitations of this approach have already been described at the gene level, while some newer arise in the miRNA scenario.
Here, researchers from the

 


 

13/05/2016 - 17:36

Matias M Falco, from the Computational Genomics department, was awarded to the best talk with "The pan-cancer pathological regulatory landscape". 

Presentation available here

 


 

09/03/2016 - 16:03
Asunción Gallego, recién graduada en Ingeniería Informática y galardonada con el premio al mejor TFG de su promoción, acaba de publicar los resultados de su trabajo en la revista BMC Bioinformatics.
 
Asunción realizó su TFG dirigida por el profesor Vicente Arnau (Dpto. Informática, ETSE-UV) y el investigador Dr. Joaquín Tárraga, del laboratorio de Genómica Computacional del Centro de Investigación Príncipe Felipe (CIPF), dirigido por el Dr. Joaquín Dopazo.

 


 

02/02/2016 - 09:31

El Dr. Joaquín Dopazo, Director del Departamento de Genómica Computacional del Centro de Investigación Príncipe Felipe, ha elaborado un catálogo detallado de la variabilidad genética de la población española a partir de las secuencias de exomas (parte del genoma que codifica para proteínas) completos de 267 individuos representativos de la población española sana, obtenidas por el Dr.

 


 

04/12/2015 - 11:21

Una profesora del Departamento de Ciencias Biomédicas de la Universidad CEU Cardenal Herrera y miembro del Grupo de Investigación en Hematología y Hematoterapia del Hospital La Fe de Valencia, Mariam Ibáñez, en colaboración con José Carbonell del Departamento de Genómica Computacional del CIPF, liderado por el doctor Joaquín Dopazo, han logrado determinar un grupo de genes recurrentes que podrían estar implicados en el origen de la leucemia mieloide aguda.

 


 

06/11/2015 - 09:39

Cancer Drivers, Protein Complex Prediction, and Crawling and Gliding Cells: the PLOS Comp Biol October Issue

 
Posted November 5, 2015 by bchadwick in Cancer, Cell biology, Community, Computational biology, Molecular biology, PLOS Computational Biology
Here are our highlights from October’s PLOS Computational Biology:
 
 
 

A Pan-Cancer Catal

 


 

21/10/2015 - 09:51

In a collaborative study led by Sanford Burnham Prebys Medical Discovery Institute (SBP), researchers have combined two publicly available 'omics' databases to create a new catalogue of 'cancer drivers'. Cancer drivers are genes that when altered, are responsible for cancer progression. The researchers used cancer mutation and protein structure databases to identify mutations in patient tumors that alter normal protein-protein interaction (PPI) interfaces.

 


 

21/10/2015 - 09:47

Newswise — La Jolla, Calif., October 20, 2015 – In a collaborative study led by Sanford Burnham Prebys Medical Discovery Institute (SBP), researchers have combined two publicly available ‘omics’ databases to create a new catalogue of ‘cancer drivers’. Cancer drivers are genes that when altered, are responsible for cancer progression. The researchers used cancer mutation and protein structure databases to identify mutations in patient tumors that alter normal protein-protein interaction (PPI) interfaces.