Aplicaciones NGS en estudios transcriptómicos
Esta práctica incluye varios ejercicios para trabajar con los diferentes módulos de análisis que nos ofrece la suite Babelomics 5. Desde el navegador Firefox iremos al siguiente enlace: http://babelomics.bioinfo.cipf.es/
- Preprocessing for RNA-Seq and microRNA-Seq
- Expression for RNA-Seq and microRNA-Seq
Para comenzar, os sugerimos que os creéis un usuario en la herramienta, que nos permitirá almacenar los jobs que lancemos y visualizar los resultados en cualquier momento y desde cualquier ubicación.
Los métodos descritos están orientados a datos de RNA-Seq y microRNA-Seq, aunque algunos de ellos son también aplicables a datos procedentes de otras tecnologías o áreas ómicas. (Al final de la práctica se incluyen algunas actividades para ver su funcionamiento).
Si tienes alguna duda o sugerencia sobre el funcionamiento de la herramienta, por favor contáctanos en babelomics@cipf.es
Muchas gracias por vuestro feed-back!